Parasiten

Amöben, Giardien und andere sind Protozoen (Einzeller), die parasitär im Darm leben.
Bei Ratten sind v. a. Giardia muris, Spironucleus (Hexamita) muris, Tritrichomonas muris und Entamoeba muris häufig bei Protozoenbefund zu finden.

Nematoden sind Darmparasiten, die durch direkten Kontakt der Tiere, aber auch über die kontaminierte Umgebung, Futter übertragen werden können.
Häufig vorkommende Nematoden sind die Oxyuren Syphacia obvelata, Syphacia muris, und Aspiculurus tetraptera, die im Dickdarm ihres Wirts leben. Außerdem bei Ratten der Peitschenwurm Trichuris muris (parasitiert in der Blinddarmschleimhaut), sowie seltener Nippostrongylus muris, Nematospiroides dubius und Strongyloides ratti (als Parasiten im Dünndarm).

Milben gehören zu den Spinnentieren und saugen an den Ratten Blut, leben von Hautschuppen und anderen Körperflüssigkeiten.

Rattenläuse gehören zu den Arten Polyplax serrata und Polyplax spinulosa. Sie sind streng wirtsspezifisch und werden nur im direkten Kontakt von Ratte zu Ratte übertragen oder wenn eine Ratte mit Läusen gehandhabt wird und gleich darauf eine andere Ratte angefasst wird.
Die Läuse saugen an den Ratten Blut. Ohne Blutmahlzeit überleben sie max. 4 Tage. Die Nissen (Eier) kleben an den Haaren, nahe der Hautoberfläche.

In der normalen Haltung eher selten vorkommend, aber bei Notfällen aus schlechter Haltung durchaus möglich. Bei Ratten vorkommend sind Eimeria-Arten (z. B. E. contorta, E. nieschulzi, E. separata).
Ausgeschieden werden die Oozysten (Dauerstadien), die noch monatelang infektiös bleiben.